| CZ.01.1.02/0.0/0.0/15_030/0007715 | Projekt na ochranu práv průmyslového vlastnitctví - Jihočeská univerzita v Ćeských Budějovicích | 544256 | PN40a | 241388 | 241388 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000441 | Mechanismy a dynamika makromolekulárních komplexů: Od jednotlivých molekul po buňky | 0 | PP37 | 207409734 | 207409734 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_017/0002614 | Výzkumná infrastruktura pro vzdělávací účely FROV JU | 0 | PP37 | 91573194 | 91573194 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_025/0007370 | Reprodukční a genetické postupy pro uchování biodiverzity ryb a akvakulturu | 0 | PP37 | 46236526 | 46236526 | |
| CZ.02.2.67/0.0/0.0/16_016/0002356 | Rozvoj JU - ERDF | 544256 | PP42 | 21952142 | 21952142 | |
| CZ.02.2.67/0.0/0.0/16_016/0002409 | Simulační centrum pro zdravotnické obory Zdravotně sociální fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích | 544256 | PP42 | 57516137 | 57516137 | |
| CZ.02.2.67/0.0/0.0/17_044/0008542 | Rozvoj JU - Studijní prostředí | 0 | PP42 | 96741081 | 96741081 | |
| CZ.02.2.67/0.0/0.0/18_057/0013254 | Rozvoj JU - ERDF II | 544256 | PP37 | 80249007 | 80249007 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_014/0000628 | Rozvoj kanceláře transferu technologií na Jihočeské univerzitě | 0 | PP37 | 18466753 | 18466753 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_015/0002348 | Rozvoj JU - ESF | 544256 | PP37 | 119955361 | 119955361 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_018/0002616 | Rozvoj výzkumně zaměřených studijních programů FROV JU | 0 | PP37 | 10457440 | 10457440 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_027/0008364 | Rozvoj JU - Mezinárodní mobility | 0 | PP43 | 19945206 | 19945206 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_028/0006192 | Rozvoj JU - Kapacity pro VaV | 0 | PP37 | 30681862 | 30681862 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/17_050/0008486 | Rozvoj JU - Mezinárodní mobility - MSCA-IF | 0 | PP43 | 5641267 | 5641267 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_053/0016975 | Rozvoj JU - Mezinárodní mobility II | 0 | PP37 | 21941972 | 21941972 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_054/0014638 | Rozvoj JU - Kapacity pro VaV II | 0 | PP37 | 21158707 | 21158707 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_056/0013061 | Rozvoj JU - ESF II | 544256 | PP37 | 22650748 | 22650748 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_070/0010479 | Lidská důstojnost mezi antropologií a metafyzikou. Pedro de Ledesma (1544-1616) a jeho současníci | 0 | PP43 | 3266208 | 3266208 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/20_079/0017633 | MATTER MSCA MOBILITA | 0 | PP36 | 4006392 | 4006392 | |
| CZ.02.3.68/0.0/0.0/16_010/0000523 | Podpora vzájemného učení pedagogů MŠ | 0 | PP43 | 34328928 | 34328928 | |
| CZ.02.3.68/0.0/0.0/16_036/0005322 | Podpora rozvíjení informatického myšlení | 0 | PP43 | 109793169 | 109793169 | |
| CZ.02.3.68/0.0/0.0/16_038/0006960 | Inovace přípravy učitelů pro praxi | 0 | PP37 | 39643743 | 39643743 | |
| CZ.02.3.68/0.0/0.0/19_068/0016157 | Inovace studia učitelství pro střední školy na Jihočeské univerzitě | 0 | PP37 | 16694817 | 16694817 | |
| CZ.03.1.51/0.0/0.0/15_035/0001736 | Dětská skupina Jihočeské univerzity 1 | 0 | PP43 | 4617480 | 4617480 | |
| CZ.03.1.51/0.0/0.0/15_035/0001737 | Dětská skupina Jihočeské univerzity 2 | 0 | PP43 | 2308740 | 2308740 | |
| CZ.03.1.51/0.0/0.0/17_073/0008736 | Dětská skupina Jihočeské univerzity 1 - Kvítek | 0 | PP43 | 3768000 | 3768000 | |
| CZ.03.1.51/0.0/0.0/17_073/0008882 | Dětská skupina Jihočeské univerzity 2 - Kvítek | 0 | PP43 | 1884000 | 1884000 | |
| CZ.03.1.51/0.0/0.0/19_101/0016648 | Dětská skupina Jihočeské univerzity 1 - Kvítek | 0 | PP37 | 3299760 | 3299760 | |
| CZ.03.1.51/0.0/0.0/19_101/0016970 | Dětská skupina Jihočeské univerzity 2 - Kvítek | 0 | PP37 | 1657260 | 1657260 | |