| CZ.01.1.02/0.0/0.0/15_030/0007012 | Projekt na ochranu práv průmyslového vlastnictví - Fyzikální ústav AV ČR, v.v.i. | 539210 | PP36 | 1958671 | 1958671 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000437 | Kosmologie, gravitace a temný sektor vesmíru | 554782 | PP37 | 160587762 | 160587762 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000445 | Pokročilá příprava funkčních materiálů: Od mono k bi- a tri-chromatické excitaci s použitím tvarovaných laserových pulsů | 539210 | PP37 | 177206252 | 177206252 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000449 | High Field Initiative (Výzkum velmi intenzivních polí) | 539210 | PP37 | 235956040 | 235956040 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_006/0000674 | HiLASE Centre of Excellence | 539210 | PP37 | 930105832 | 930105832 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_008/0000162 | ELI - EXTREME LIGHT INFRASTRUCTURE - fáze 2 | 539210 | PP37 | 1859487765 | 1859487765 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001402 | Budoucnost české účasti na Observatoři Pierra Augera (AUGER-CZ) | 0 | PP42 | 19267551 | 19267551 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001403 | Evropská podpora české účasti na budování CTA observatoře (CTA-CZ) | 0 | PP41 | 19759181 | 19759181 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001404 | CERN Computing | 0 | PP42 | 19987874 | 19987874 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001405 | LNSM - Laboratoř spintroniky | 0 | PP37 | 43460546 | 43460546 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001406 | Středisko analýzy funkčních materiálů | 0 | PP42 | 20999900 | 20999900 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_013/0001793 | Pokročilé simulační nástroje pro ELI Beamlines | 539210 | PP42 | 19993087 | 19993087 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000760 | Fyzika pevných látek pro 21. století | 0 | PP37 | 560348566 | 560348566 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000789 | Pokročilý výzkum s využitím fotonů a částic vytvořených vysoce intenzivními lasery | 539210 | PP37 | 1269000000 | 1269000000 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_046/0016007 | Evropská podpora české účasti na budování CTA observatoře II (CTA-CZ) | 0 | PP37 | 10758000 | 10758000 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_046/0016010 | Budoucnost české účasti na Observatoři Pierra Augera II (AUGER-CZ) | 0 | PP37 | 8808063 | 8808063 | |
| CZ.02.1.01/0.0/0.0/18_046/0016013 | Investice pro zpracování dat a testování detektorů pro VI CERN-CZ | 0 | PP37 | 14998500 | 14998500 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_027/0008215 | Mobilita výzkumných pracovníků FZU | 539210 | PP43 | 41951287 | 41951287 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/16_028/0006223 | Zkvalitnění strategického řízení Fyzikálního ústavu AV ČR | 554782 | PP37 | 66522629 | 66522629 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_053/0016627 | Mobilita výzkumných, technických a administrativních pracovníků FZU | 554782 | PP37 | 67995605 | 67995605 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_054/0014658 | Strategická tvorba intenzivního rozvoje kapacit Fyzikálního ústavu AV ČR | 554782 | PP37 | 48362219 | 48362219 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_070/0010126 | Mezinárodní mobilita MSCA-IF II FZU | 539210 | PP43 | 5898960 | 5898960 | |
| CZ.02.2.69/0.0/0.0/20_079/0017754 | Mezinárodní mobilita MSCA-IF IV FZU | 539210 | PP37 | 11881968 | 11881968 | |
| CZ.07.1.02/0.0/0.0/16_023/0000115 | Fyzika k vašim službám | 0 | PP42 | 12144852 | 12144852 | |
| CZ.07.1.02/0.0/0.0/16_040/0000384 | Efektivní využití odpadního tepla | 0 | PP42 | 9842631 | 9842631 | |
| CZ.07.1.02/0.0/0.0/17_049/0000831 | Nedestruktivní metody testování památek | 0 | PP37 | 19712776 | 19712776 | |
| CZ.07.1.02/0.0/0.0/17_049/0000832 | Pokročilé technologie pro bezpečnost potravin | 0 | PP37 | 12913429 | 12913429 | |